El primer tanque contiene la zona aeróbica, micro-aerofílica y anóxica, así como una zona de clarificación, mientras que el segundo tanque incluye la zona anaeróbica, una zona de separación sólido-líquido y una unidad de filtración. La zona aeróbica es un reactor “de aire en ascenso” que contiene difusores en el fondo para introducir aire en la zona. Las burbujas de aire mezclan el líquido y su contenido de micro-organismos y proporcionan oxígeno para los procesos biológicos aeróbicos que tienen lugar en esta zona. La aireación también produce circulación de líquido entre la zona aeróbica y sus zonas micro-aerófilas y anóxicas adyacentes que se encuentran a los lados y debajo de la zona aeróbica, respectivamente. La zona aeróbica contiene micro-organismos suspendidos de grupos heterotróficos y autótrofos que crecen dentro del líquido circulante, conocido como “licor mezclado”. En la zona aeróbica, materiales transportadores sueltos u objetos estacionarios, soportan la fijación de la biomasa microbiana y la formación de la biopelícula microbiana.